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普美瑞云平台提供各种生物计算功能，是国内目前靠前的聚合各个实验室或者科学家的生物云计算平台，算力级别属于高度

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q u i p m e n t 小 分 子 对 接 工 具 P R O T A C 设 计 工 具 大 分 子 对 接 工 具 分 子 动 力 学 模 拟 工 具 常 用 小 工 具 蛋 白 小 分 子 对 接 基 于 深 度 学 习 算 法 的 蛋 白 小 分 子 复 合 物 三 维 结 构 预 测 工 具 ， 根 据 三 维 结 构 可 获 得 化 合 物 与 特 定 残 基 的 相 互 作 用 信 息 ， 为 小 分 子 的 结 构 优 化 提 供 线 索 。 基 于 信 号 通 路 的 分 子 对 接 根 据 信 号 通 路 可 选 择 该 通 路 相 关 的 内 置 靶 标 ， 针 对 部 分 或 所 有 该 通 路 相 关 的 靶 标 进 行 分 子 对 接 。 虚 拟 筛 选 基 于 深 度 学 习 算 法 的 虚 拟 筛 选 工 具 ， 快 速 筛 选 化 学 多 样 性 小 分 子 库 ， 获 得 潜 在 活 性 分 子 列 表 。 反 向 对 接 给 定 目 标 分 子 ， 筛 选 内 置 靶 标 结 构 库 ， 获 得 该 分 子 可 能 结 合 的 潜 在 靶 标 。 基 于 特 定 疾 病 的 分 子 对 接 根 据 特 定 疾 病 可 选 择 该 疾 病 相 关 的 内 置 靶 标 ， 针 对 部 分 或 所 有 该 疾 病 相 关 的 靶 标 进 行 分 子 对 接 。 自 定 义 靶 标 集 的 分 子 对 接 用 户 可 建 立 自 定 义 的 靶 标 集 ， 针 对 部 分 或 所 有 自 定 义 靶 标 集 进 行 分 子 对 接 。 蛋 白 降 解 靶 向 嵌 合 体 ( P R O T A C ) ， 是 一 种 新 颖 的 药 物 设 计 策 略 ， 通 过 利 用 细 胞 内 的 泛 素 蛋 白 酶 体 蛋 白 降 解 机 制 来 实 现 降 解 蛋 白 质 。 P R O T A C 三 元 体 结 构 预 测 与 l i n k e r 设 计 预 测 靶 蛋 白 （ P O I ） 、 E 3 连 接 酶 、 P R O T A C 三 元 体 复 合 物 三 维 结 构 ， 评 估 不 同 长 度 l i n k e r 片 段 形 成 P R O T A C 分 子 的 合 理 性 抗 原 抗 体 对 接 基 于 深 度 学 习 算 法 的 抗 原 抗 体 复 合 物 三 维 结 构 预 测 工 具 ， 根 据 三 维 结 构 提 供 界 面 接 触 残 基 信 息 及 能 量 贡 献 ， 为 C D R 优 化 等 提 供 线 索 。 蛋 白 蛋 白 对 接 蛋 白 蛋 白 复 合 物 三 维 结 构 预 测 工 具 ， 为 蛋 白 质 结 构 功 能 研 究 提 供 线 索 。 蛋 白 R N A 对 接 蛋 白 质 R N A 复 合 物 结 构 预 测 工 具 蛋 白 D N A 对 接 蛋 白 质 D N A 复 合 物 结 构 预 测 工 具 蛋 白 相 互 作 用 预 测 基 于 目 标 蛋 白 序 列 预 测 可 能 形 成 相 互 作 用 的 对 象 蛋 白 蛋 白 小 肽 对 接 蛋 白 小 肽 复 合 物 结 构 预 测 对 于 小 肽 的 结 构 与 功 能 研 究 、 小 肽 药 物 筛 选 与 优 化 十 分 重 要 蛋 白 小 分 子 体 系 结 合 分 子 动 力 学 模 拟 （ M D ） 和 结 合 自 由 能 计 算 （ M M P B / G B S A ） 预 测 蛋 白 小 分 子 复 合 物 的 稳 定 性 ， 以 及 蛋 白 小 分 子 之 间 的 结 合 亲 和 力 蛋 白 体 系 结 合 分 子 动 力 学 模 拟 （ M D ） 和 结 合 自 由 能 计 算 （ M M P B / G B S A ） 预 测 蛋 白 体 系 的 稳 定 性 ， 以 及 蛋 白 分 子 之 间 的 结 合 亲 和 力 核 酸 小 分 子 体 系 结 合 分 子 动 力 学 模 拟 （ M D ） 和 结 合 自 由 能 计 算 （ M M P B / G B S A ） 预 测 核 酸 小 分 子 复 合 物 的 稳 定 性 ， 以 及 核 酸 小 分 子 之 间 的 结 合 亲 和 力 蛋 白 核 酸 体 系 结 合 分 子 动 力 学 模 拟 （ M D ） 和 结 合 自 由 能 计 算 （ M M P B / G B S A ） 预 测 蛋 白 核 酸 复 合 物 的 稳 定 性 ， 以 及 蛋 白 核 酸 之 间 的 结 合 亲 和 力 小 分 子 结 构 聚 类 2 D 化 学 结 构 聚 类 分 析 基 于 配 体 的 靶 点 搜 寻 通 过 分 子 相 似 性 搜 索 ， 寻 找 目 标 分 子 潜 在 的 作 用 靶 点 。 3 D 相 似 性 搜 索 通 过 计 算 待 查 询 分 子 与 模 版 分 子 之 间 的 相 似 性 得 分 ， 快 速 筛 选 出 符 合 需 求 的 相 似 分 子 。 分 子 性 质 预 测 小 分 子 的 理 化 性 质 、 药 代 动 力 学 特 征 和 毒 性 属 性 预 测 。 小 分 子 结 构 文 件 转 换 小 分 子 结 构 转 换 、 3 D 构 象 生 成 、 加 氢 与 赋 予 原 子 电 荷 我 们 的 服 务 O u r s e r v i c e s 点 击 咨 询 客 服 在 线 算 法 工 具 ， 助 力 精 准 科 研 我 们 提 供 多 种 领 先 的 经 典 算 法 工 具 ， 包 括 蛋 白 质 结 构 预 测 、 分 子 对 接 、 虚 拟 筛 选 、 P R O T A C 计 算 、 M D 模 拟 、 反 向 寻 靶 等 。 通 过 便 捷 的 网 页 登 录 平 台 ， 您 无 需 复 杂 设 置 即 可 轻 松 操 作 ， 快 速 获 取 详 尽 的 结 果 分 析 ， 为 您 的 科 研 工 作 提 供 强 有 力 的 支 持 。 专 家 定 制 化 服 务 ， 解 决 您 的 研 发 需 求 普 美 瑞 生 物 科 技 汇 聚 了 来 自 计 算 机 、 化 学 、 生 物 与 医 学 领 域 的 资 深 专 家 团 队 ， 拥 有 深 厚 的 跨 学 科 背 景 。 我 们 深 刻 理 解 生 命 科 学 领 域 的 研 发 需 求 ， 致 力 于 为 每 位 客 户 提 供 一 对 一 的 定 制 化 服 务 。 根 据 您 的 具 体 项 目 需 求 ， 我 们 为 您 量 身 设 计 个 性 化 的 实 验 方 案 ， 确 保 为 您 的 科 研 工 作 提 供 最 优 解 决 方 案 。 多 样 化 实 验 服 务 ， 助 力 研 究 深 入 开 展 我 们 提 供 全 方 位 的 实 验 服 务 ， 包 括 细 胞 生 长 曲 线 测 定 、 细 胞 侵 袭 与 迁 移 实 验 、 平 板 克 隆 实 验 、 稳 转 细 胞 系 构 建 、 细 胞 周 期 与 凋 亡 分 析 、 R e a l T i m e P C R 、 W e s t e r n B l o t （ W B ） 、 蛋 白 稳 定 性 测 定 、 K d 值 测 定 等 多 种 实 验 项 目 。 我 们 的 专 业 团 队 将 为 您 量 身 定 制 实 验 方 案 ， 确 保 结 果 准 确 、 可 靠 ， 为 您 的 研 究 提 供 强 有 力 的 数 据 支 持 。 全 方 位 软 / 硬 件 系 统 搭 建 服 务 ， 助 力 高 效 研 发 普 美 瑞 生 物 科 技 为 您 提 供 完 整 的 计 算 生 物 学 软 硬 件 解 决 方 案 ， 涵 盖 硬 件 设 施 配 置 、 环 境 搭 建 、 系 统 管 理 、 数 据 库 开 发 、 软 件 安 装 与 调 试 等 全 方 位 技 术 支 持 。 我 们 的 专 业 团 队 将 根 据 您 的 需 求 ， 提 供 定 制 化 方 案 ， 确 保 您 的 科 研 平 台 稳 定 高 效 运 行 ， 助 力 您 的 项 目 顺 利 推 进 。 案 例 展 示 C a s e P r e s e n t a t i o n 分 子 对 接 虚 拟 筛 选 分 子 动 力 学 数 据 库 系 统 与 网 站 开 发 蛋 白 蛋 白 对 接 揭 示 N L R P 6 和 p 8 5 α 之 间 的 作 用 机 制 通 过 计 算 与 实 验 相 结 合 的 方 式 ， 揭 示 了 N L R P 6 通 过 自 噬 途 径 选 择 性 降 解 p 8 5 α ， 激 活 P I 3 K / A K T 信 号 通 路 ， 进 而 促 进 肿 瘤 发 生 的 机 制 。 P u b l i c a t i o n D a t a ： 2 0 2 1 0 8 0 1 蛋 白 蛋 白 对 接 揭 示 S e r p i n a 3 c 与 凝 血 酶 之 间 的 作 用 机 制 通 过 实 验 与 计 算 相 结 合 的 方 法 ， 深 入 探 讨 了 S e r p i n a 3 c 与 凝 血 酶 （ t h r o m b i n ） 之 间 的 作 用 机 制 。 P u b l i c a t i o n D a t a ： 2 0 2 1 0 8 0 1 蛋 白 小 分 子 对 接 揭 示 穿 山 龙 作 用 于 心 肌 缺 血 的 机 制 综 合 运 用 多 种 技 术 手 段 ， 深 入 探 究 了 穿 山 龙 抗 心 肌 缺 血 的 作 用 机 制 ， 证 明 穿 山 龙 中 的 甾 体 皂 苷 类 成 分 可 能 是 其 治 疗 心 肌 缺 血 的 物 质 基 础 ， 且 穿 山 龙 治 疗 心 肌 缺 血 是 多 成 分 与 多 靶 点 相 互 作 用 的 结 果 。 P u b l i c a t i o n D a t a ： 2 0 2 1 0 8 0 1 分 子 动 力 学 模 拟 、 虚 拟 筛 选 与 实 验 结 合 发 现 S T A T 3 小 分 子 抑 制 剂 通 过 M D 模 拟 和 S B V L S 方 法 成 功 发 现 了 针 对 S T A T 3 S H 2 结 构 域 的 强 效 小 分 子 抑 制 剂 ， 并 通 过 实 验 验 证 了 这 些 抑 制 剂 的 生 物 活 性 和 作 用 机 制 。 P u b l i c a t i o n D a t a ： 2 0 2 1 0 8 0 1 虚 拟 筛 选 与 实 验 结 合 发 现 N S D s 小 分 子 抑 制 剂 通 过 基 于 结 构 的 虚 拟 筛 选 与 实 验 相 结 合 的 方 法 ， 成 功 发 现 了 针 对 N S D s 的 强 效 小 分 子 抑 制 剂 ， 这 些 抑 制 剂 在 体 内 和 体 外 均 表 现 出 显 著 的 生 物 活 性 ， 为 N S D s 在 癌 症 中 的 生 物 学 作 用 研 究 提 供 了 有 价 值 的 工 具 。 P u b l i c a t i o n D a t a ： 2 0 2 1 0 8 0 1 基 于 M D 模 拟 和 M M / G B S A 计 算 探 讨 野 生 型 与 突 变 型 蛋 白 体 系 的 分 子 作 用 机 制 通 过 M D 模 拟 和 M M / G B S A 结 合 自 由 能 计 算 ， 深 入 研 究 了 S A P A P 野 生 型 和 突 变 型 E P B M 与 S h a n k 3 N P D Z 之 间 的 相 互 作 用 机 制 。 P u b l i c a t i o n D a t a ： 2 0 2 1 0 8 0 1 分 子 动 力 学 模 拟 、 虚 拟 筛 选 与 实 验 结 合 发 现 S T A T 3 小 分 子 抑 制 剂 通 过 M D 模 拟 和 S B V L S 方 法 成 功 发 现 了 针 对 S T A T 3 S H 2 结 构 域 的 强 效 小 分 子 抑 制 剂 ， 并 通 过 实 验 验 证 了 这 些 抑 制 剂 的 生 物 活 性 和 作 用 机 制 。 P u b l i c a t i o n D a t a ： 2 0 2 1 0 8 0 1 基 于 M D 模 拟 探 索 R N A 结 合 人 类 A r g o n a u t e 2 的 作 用 机 制 通 过 分 子 动 力 学 模 拟 方 法 ， 详 细 研 究 了 h A g o 2 与 R N A 的 结 合 过 程 ， 从 R M S D 、 R M S F 、 氢 键 分 析 、 D C C M 、 P C A 、 F E L 等 多 个 方 面 出 发 ， 深 入 分 析 了 A g o 2 R N A 识 别 的 分 子 机 制 。 P u b l i c a t i o n D a t a ： 2 0 2 1 0 8 0 1 E A R D B ， 发 现 和 研 究 雌 激 素 和 雄 激 素 受 体 调 节 剂 的 工 具 本 文 构 建 的 E A R D B 在 线 系 统 ， 提 供 了 基 于 蛋 白 多 构 象 对 接 功 能 或 基 于 配 体 的 化 学 结 构 相 似 性 搜 索 功 能 ， 可 以 预 测 目 标 化 合 物 是 否 为 潜 在 的 E R α ， E R β 或 A R 调 节 剂 。 P u b l i c a t i o n D a t a ： 2 0 2 1 0 8 0 1 n C o V D o c k 2 ， 用 于 预 测 C O V I D 1 9 靶 点 与 潜 在 配 体 的 结 合 模 式 本 文 构 建 的 n C o V D o c k 2 靶 点 筛 选 系 统 ， 可 以 用 于 预 测 野 生 型 和 突 变 型 S A R S C o V 2 治 疗 靶 点 及 其 潜 在 配 体 （ 小 分 子 、 多 肽 、 抗 体 ） 之 间 的 结 合 模 式 。 该 服 务 器 为 预 测 结 果 提 供 了 友 好 的 界 面 和 结 合 模 式 可 视 化 ， 使 其 成 为 C O V I D 1 9 药 物 发 现 的 有 用 工 具 。 P u b l i c a t i o n D a t a ： 2 0 2 1 0 8 0 1 关 于 普 美 瑞 快 捷 链 接 马 上 联 系 公 司 核 心 研 发 团 队 由 海 归 博 士 组 成 ， 专 业 背 景 包 括 应 用 数 学 、 药 物 化 学 、 医 学 基 因 学 等 ， 形 成 了 算 法 开 发 、 算 法 应 用 、 实 验 验 证 三 大 关 键 环 节 组 成 的 研 发 闭 环 ， 可 针 对 新 药 研 发 中 不 同 阶 段 的 关 键 问 题 高 效 地 进 行 算 法 迭 代 ， 提 供 最 佳 解 决 方 案 。 首 页 公 司 介 绍 云 市 场 联 系 我 们 江 苏 常 州 中 国 科 学 院 遗 传 研 究 中 心 i n f o @ p u m e i r u i . c o m 0 5 1 9 6 8 0 0 7 0 2 6

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